실무중심의 경영 전문인력 양성을 위해 경영전문대학원 제도가 1998년에 도입되었다. 이 제도에 의해 경영전문대학원을 인가 받아 운영하고 있던 성균관대학교 등의 사례를 분석하여 경영전문대학원 제도의 운영현황과 이슈를 분석한다. 1998년에 도입한 경영전문대학원 제도는 사회적으로 점점 중요시 되고 있는 국내 주간 MBA 교육의 제도적 틀로서의 역할을 하지 못하여 왔다. 주간 MBA 교육과정의 이상적인 틀로서 도입된 경영전문대학원 제도는 야간 경영대학원의 폐지라는 인가조건의 제약을 기피하는 대학교들에게 외면당하여 왔다. 이에 대한 대응으로 교육부는 야간과정을 포함하는 새로운 경영전문대학원 제도를 2006년에 실시하였다. 새로운 제도에서 6개 대학교가 2006년 9월부터, 5개 대학교가 2007년 3월부터 경영전문대학원을 설치 운영하도록 인가 받았다. 구 제도의 문제점과 가능한 해결방안을 논의하고 새 제도가 어떻게 대학원 운영과 관련된 문제점을 해결하였는지를 살펴본다.